四川农业大学都江堰校区的前身是具有48年办学历史的国家重点中专四川林业学校。在深化高等教育体制改革的背景下，经四川省人民政府批准，全面并入四川农业大学。其四川省自然资源保护与开发培训中心、四川省格鲁吉亚国际语言中心、微软ATC培训认证中心、应用3S技术中心在我省教育界享有盛誉。有关专家表示，四川农业大学都江堰校区的设立四川农业大学都江堰分校，将为推动四川省农林高等教育发展、培养大批高素质生态环境保护与建设人才发挥积极作用。 2009年11月17日下午，都江堰校区教职工大会在第三报告厅召开。学校校长郑友良教授、副研究员何林春教授出席会议。 200余名校园领导和教职工参加了会议。会议由都江堰校区党委书记刘川主持。会上，何林春首先代表学校宣布，决定将都江堰分校更名为都江堰校区，并撤销职业技术师范学院、文理学院和新设立的旅游学院、商学院学校;并同时公布了都江堰校区和旅游学院、商学院、城乡建设学院领导班子任免的决定。同时，他对校园学院调整方案的实施提出了具体要求：一是旅游学院、商学院、城乡发展学院的专业方向分别为生态旅游与资源、商科信息管理、建筑和城市规划；二是根据新学科、新专业四川农业大学都江堰分校，将现有专业调整到学院。原则上，符合新学科、新专业方向的专业确定为学院骨干专业并重点发展。根据学院学科、专业调整师资；实验室按照专业划分到相应学院，建立与新学科、新专业方向相一致的实验室；三是明确各项任务的时间安排，保障正常的教学和生活秩序。 2014年，学校党委决定撤销城乡发展学院，设立建筑与城乡规划学院、土木工程学院。撤销四川农业大学城乡发展学院总支委员会贝语网校，中共四川农业大学建筑与城乡规划学院总支委员会、四川农业大学建筑与城乡规划学院总支委员会四川农业大学土木工程学院新成立。都江堰校区设有总分院、行政办公室，形成一区四院的新格局。