复旦大学上海医学院（原上海医科大学）创建于1927年，前身是国立中山大学第四医学院。 这是第一所由中国人民创办的国立大学医学院，严福清担任首任院长。 1932年独立，定名为国立上海医学院（简称上海医学院）。 书院校训是“正友明道”，出自《汉书·董仲舒传》：正友不求自身利益，澄清道不计其功。 1939年，因抗日战争爆发，迁居云南昆明。 1940年，迁居四川重庆。 1946年抗日战争胜利后，迁回上海。 1952年更名为“上海第一医学院”。 1959年被定为全国16所重点高等学校之一。 1985年更名为“上海医科大学”。 2000年，上海医科大学与复旦大学合并组建新的复旦大学。 2012年，新上海医学院成立。 作为复旦大学党和政府派出机构，根据学校授权，行使学校人才培养、科学研究、学科建设、发展规划、资源配置、对外交流等职责。 具有相对独立的经营权。 2017年，中共复旦大学上海医学院工作委员会（简称上海医学院党工委）成立，是学校党委的派出机构。 2018年12月21日，教育部、国家卫生健康委员会、上海市人民政府正式签约，共建主办复旦大学上海医学院及其直属医院。 2019年6月14日，复旦大学上海医学院领导班子宣布召开此次会议。 上海市委决定成立复旦大学上海医学院委员会和复旦大学上海医学院纪律检查委员会。 同日，复旦大学上海医学院高水平地方大学试点建设正式启动。

有直属学院、系9个。 设有9个本科专业：临床医学（八年制）、临床医学（五年制）、临床医学（六年制）、基础医学、法医学、预防医学、公用事业管理、药学、护理学、和高等职业教育。 1个专业：护理学。 拥有博士学位授予权的一级学科9个（医学类6个、非医学类3个），博士后流动站8个：生物学、基础医学、临床医学、公共卫生与预防医学、中西医结合医学 综合、药学、公共管理（医学）、护理。 博士生2731人，硕士生2899人，本科生4035人上海医科大学，专科生113人，共计9665人。 有中国科学院院士6人，中国工程院院士5人，教育部“长江学者奖励计划”特聘教授29人，讲座教授8人，青年长江学者12人。 拥有“国家重点基础研究发展计划（含重大科研计划）”项目首席科学家17人，主持2018年国家重点研发计划专项9项（其中附属医院牵头项目4项）、5项国家重大科技专项（其中附属医院牵头项目3项）。 国家杰出青年基金获得者39人，国家自然科学基金杰出青年基金获得者22人。

拥有生物学、基础医学、中西医结合等3个一级国家重点学科，内科（心血管病、肾病、感染性疾病）、儿科、神经病学、影像医学和医学等12个二级国家重点学科。核医学、外科、眼科、耳鼻喉科、肿瘤科、妇产科、流行病学与卫生统计学、药学、社会医学与健康管理； 设有国家老年疾病临床医学研究中心、国家放射治疗临床医学研究中心、国家儿童医学中心； 有1个国家重点实验室：医学神经生物学； 5个教育部重点实验室：医学分子病毒学、代谢分子医学、智能给药、公共卫生与安全、致癌与侵袭原理上海医科大学，1个教育部尖端科学中心：脑科学； 9个国家卫健委（卫生部）重点实验室：复合糖、抗生素临床药理学、手功能重建、卫生技术评估、医学分子病毒学、听力医学、近视、病毒性心脏病、新生儿疾病，9个上海市重点实验室：周边神经显微外科、医学图像处理与计算机辅助技术、器官移植、女性生殖内分泌相关疾病、肾脏疾病与血液净化、视力损伤与重建、乳腺肿瘤、出生缺陷防治、临床老年医学。

上海医学院第一医学研究楼（复兴楼）、学生学院、医学图书馆、综合游泳池、地下停车库已投入使用，第二医学研究楼正在建设中。

附属医院17所（含），即复旦大学附属中山医院、复旦大学附属华山医院、复旦大学附属肿瘤医院、复旦大学附属妇产医院、复旦大学附属儿科医院、眼科、复旦大学附属医院耳鼻喉科、复旦大学附属金山医院、上海市复旦大学附属第五人民医院、上海（复旦大学附属）公共卫生临床中心、复旦大学附属华东医院、浦东医院复旦大学附属静安区中心医院、复旦大学附属静安区中心医院、复旦大学附属闵行医院、复旦大学精神卫生中心（筹中）、复旦大学青浦区中心医院（筹中）、复旦大学口腔医院（筹中） 、复旦大学附属徐汇医院（筹）。