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南昌大学是国家“双一流”计划世界一流学科建设高校，是江西省唯一的国家“211工程”重点建设高校，是教育部与江西省部省合建高校，是江西省高水平大学整体建设高校。学校拥有哲、经、法、教、文、史、理、工、农、医、管、艺等12个个学科门类，3个国家重点(培育)学科，15个博士学位授权一级学科, 46个硕士学位授权一级学科，1种博士专业学位授权和23种硕士专业学位授权(其中工程硕士有20个领域)，11个博士后科研流动站。学校设有5所附属医院南昌大学研究生院，共有9个国家临床重点专科。学校的化学、临床医学、农业科学(食品科学与工程为主)、工程学、材料科学、药理学与毒理学等7个学科进入ESI世界排名前1%，其中农业科学(食品科学与工程为主)进入ESI世界排名前2.2‰，临床医学进入ESI世界排名前4‰南昌大学研究生院，化学进入ESI世界排名前5.2‰。在全国第四轮学科整体水平评估中，食品科学与工程学科位列第3名。

南昌大学研究生处建于1993年，于2003年成立研究生院(筹);2010年8月研究生院党委更名为南昌大学党委研究生工作部(与研究生院合署办公)。研究生院(校党委研工部)是在校党委和校行政领导下负责统筹、协调和管理全校学位与研究生教育工作的行政及党群管理部门。部门机构设置为：综合办公室、招生办公室、培养办公室、学位与学科建设办公室、专业学位办公室、研究生思想教育办公室、研究生事务管理办公室等。南昌大学学位委员会挂靠研究生院。